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蛋白質(zhì)與RNA的互作: CLIP

染色質(zhì)免疫沉淀分析(CLIP) 實驗意義

是染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(Chromatin ImmunoPrecipitation assay)的簡稱，屬于兔疫沉淀技術(shù)的一種，用于檢測蛋白質(zhì)與DNA的相互作用。

實驗原理

其主要原理是基于RNA與其相應(yīng)的RNA結(jié)合蛋白會在紫外照射下會發(fā)生共價結(jié)合,以RNA結(jié)合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白復(fù)合物沉淀之后，回收其中的RNA片段，進行qRT-PCR檢測或測序分析。

實驗流程

1.根據(jù)研究目的決定研究方案，檢測抗體是否適用于Chip反應(yīng),設(shè)計檢測引物;

2.對生物樣品進行甲醛交聯(lián);

3.超聲破碎基因組DNA

4.染色質(zhì)免疫共沉淀;

5.qPCR檢測或(克隆)測序;1

實驗完成周期及交付標準

1.實驗周期: 1-3個月 .

2.交付標準: CLIP鑒定結(jié)果報告、分析報告、實驗報告(試劑、 耗材、實驗步驟)、原始數(shù)據(jù)等

需確認的信息

1.目的基因與蛋白信息。

2.樣本類型與種屬

3.是否需要生信分析

部分實驗代做服務(wù)